В 2002 году постановлением Главы муниципального образования г. Нягань от 16.07.2002 №1095 было образовано Муниципальное общеобразовательное учреждение «Няганская городская гимназия». Учреждение зарегистрировано межрайонной инспекцией Федеральной налоговой службы №3 по Ханты-Мансийскому автономному округу - Югре (регистрационное свидетельство № 001429061 серия 86 от 01.08.2002 г.).
Постановлением Администрации города Нягани № 402 от 02.04.2004г. Муниципальное общеобразовательное учреждение «Няганская городская гимназия» была переименована в Муниципальное общеобразовательное учреждение «Гимназия».
Постановлением Администрации города Нягани №5084 от 07.12.2011г. Муниципальное общеобразовательное учреждение «Няганская городская гимназия» переименовано в Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение муниципального образования город Нягань «Гимназия». Сокращенное наименование учреждения: МБОУ МО г. Нягань «Гимназия».
На основании приказа Комитета образования и науки от 01.06.2018 № 389 "Об изменении типа существующего муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения муниципального образования город Нягань "Гимназия" в целях создания автономного учреждения" муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение муниципального образования город Нягань «Гимназия» сменило типа с бюджетного на автономное. Сокращенное наименование учреждения: МАОУ МО г. Нягань "Гимназия".
Образовательная деятельность осуществляется на государственном языке Российской Федерации.
Формы обучения:
- в образовательной организации;
- вне образовательной организации.
Уровни общего образования, реализуемые в гимназии:
- начальное общее образование - нормативный срок обучения 4 года;
- основное общее образование - нормативный срок обучения 5 лет;
- среднее общее образование - нормативный срок обучения 2 года.
Общее количество обучающихся - 1046 человека, из них:
на уровне начального общего образования - 331 человек,
основного общего образования - 425 человек,
среднего общего образования - 290 человека.
По договорам об образовании за счет средств физических и (или) юридических лиц-отсутствует.
Средняя наполняемость классов - 25 человек.
Образовательный процесс осуществляют 65 педагогических работников.
Учебные занятия проводятся в 45 учебных кабинетах.
С 30 марта 2012 года гимназия является участником Гимназического союза России.